Ce projet de modernisation de la ligne reliant Besançon à la Chaux de Fonds vise à la fois à : - pérenniser la ligne en réalisant les travaux de confortement des ouvrages d’art et des ouvrages en terre situées de part et d’autre de la frontière dont certains menacent l’arrêt d’exploitation de la ligne - améliorer les temps de parcours des circulations grâce à un renouvellement des sections de voie permettant non seulement de supprimer les limites permanentes de vitesse mais également de rétablir les vitesses initiales de la ligne - renouveler les télécoms pour migrer les équipements de sécurité vers un nouveau support (câble optique), préfigurer la modernisation de la signalisation et connecter le pays horloger au réseau numérique à très haut débit.