Il sito archeologico di Kydonia si trova sulla collina di Kastelli e nel vicino quartiere di Splatza I resti dell'edificio degli anni minoici rivelati sulla trama appartengono a fasi successive e risalgono al periodo neopalatiale L'uso del sito era probabilmente come santuario mentre dopo la distruzione da fuoco nel 1450 aC il sito è stato utilizzato come sito di laboratorio.