A variação genética nos genomas de 3,000 animais Porco Alentejano será estudada com sequenciação de última geração. Estudos de associação entre SNPs identificados e fenótipos recolhidos (crescimento, produtividade por porca, características da carcaça, qualidade da carne) identificarão marcadores moleculares para utilização no programa de melhoramento. Será ainda desenvolvido um sistema de traçabilidade molecular para a raça e os seus produtos.