O projecto de gestão do programa operacional destina-se a assegurar uma gestão eficiente dos fundos estruturais da UE. Este projeto prevê o financiamento das despesas relacionadas com a execução das funções de administração dos fundos estruturais da UE atribuídas pela Agência para a Ciência, a Inovação e a Tecnologia, tal como previsto no Regulamento de Administração da Assistência Técnica aprovado pelo Despacho n.o 1K-337 do Ministro das Finanças, de 28 de outubro de 2014, que aprova o Regulamento de Administração da Assistência Técnica.