Um desafio partilhado pela Eslovénia e pela Itália na zona fronteiriça é o sistema de gestão territorial, que não está harmonizado e atrasa a aquisição de informações para uma gestão adequada da zona em nome das instituições públicas e das autoridades locais, regionais e nacionais. As atividades do Programa visam desenvolver um modelo conjunto para a gestão da área e a criação de diretrizes para a gestão territorial transfronteiriça.