Atlântida II vai criar o Observatório Costeiro do Atlântico Norte de Portugal, consolidando iniciativas de monitorização costeira, através da implementação de uma rede de monitorização até às 12 MN. O projeto fornecerá dados para a gestão e conservação dos ecossistemas marinhos, permitindo uma resposta às pressões humanas e aos efeitos das alterações climáticas, garantindo um equilíbrio entre desenvolvimento económico e conservação ambiental.