Os principais objetivos do projeto Observatório Regional da Avifauna são melhorar o conhecimento das diferentes espécies de aves na região, acompanhar a sua evolução, avaliar o estado de conservação e contribuir para o desenvolvimento de indicadores e disponibilizar dados validados. Tal produzirá instrumentos de apoio à decisão para reforçar as ações de conservação e gestão da biodiversidade nos territórios sub-regionais.