Cilj projekta Comenius University Science Park v Bratislavi – faza 2 je dokončanje Znanstvenega parka na področju infrastrukture in procesov, ki bo s prenosom znanja vplival na krepitev sodelovanja s socialno in gospodarsko prakso. Znanstveni park bo opremljen s sodobno in najsodobnejšo raziskovalno infrastrukturo s postopki upravljanja, rezultati raziskav in razvoja pa bodo mednarodno kakovostni in uporabni v praksi. V okviru druge faze projekta se bodo raziskovalne naloge izvajale ali zaključile v okviru strokovnih dejavnosti, ki so zahtevale uporabo infrastrukture, nameščene ob koncu prve faze projekta. Zgrajena infrastruktura se bo uporabljala tudi za preverjanje rezultatov raziskovalnih nalog, ki se izvajajo v okviru faze 1.