BAKTERIJSKE BOLEZNI RASTLIN POVZROČAJO ZNATNE GOSPODARSKE IZGUBE; NADZOR NAD NJIMI JE TEŽAVEN IN PRIČAKUJE SE, DA BO V PRIHODNOSTI TEŽJE ZARADI OMEJITEV EU GLEDE REGISTRACIJE AKTIVNIH SNOVI, KI SO NA VOLJO ZA INTEGRIRAN NADZOR. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PROIZVAJA ZRAČNE TUMORJE V GOSTITELJU, KAR POVZROČA ENO NAJPOMEMBNEJŠIH OLJČNIH BOLEZNI, ČEPRAV JE TUDI PATOGEN PRI VELIKEM ŠTEVILU RASTLINSKIH VRST. POLEG TEGA JE BIL PSV NEDAVNO RAZKRIT KOT NASTAJAJOČI PATOGEN PRI OKRASNI VRSTI MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGEN GOSPODARSKEGA POMENA V JUDIJI IN EDEN NAJPOMEMBNEJŠIH RAZISKOVALNIH MODELOV V FITOBAKTERIOLOGIJI. ENA IZMED NAJBOLJ ZAŽELENIH STRATEGIJ ZA NADZOR PPH JE UPORABA ODPORNIH JUDOVSKIH SORT. IZOLATI PPH SO RAZVRŠČENI V 9 PASEM GLEDE NA NJIHOVE INTERAKCIJE Z 8 RAZLIČNIMI JUDOVSKIMI SORTAMI, KAR JE BILO POJASNJENO Z INTERAKCIJO 5 PAROV V RAZMERJU MED GENOM IN GENOM, ČEPRAV JE MOGOČE NAREDITI VEČJO DIFERENCIACIJO PRI DO 14 PASMAH. OBA PATOSISTEMA PONUJATA IZJEMNO PRILOŽNOST ZA PREUČEVANJE MOLEKULARNE BAZE SPECIFIČNOSTI GOSTOV. PO ENI STRANI, ČEPRAV JE PPH GENETSKO HOMOGEN PATOVAR, RAZLIČNI IZOLATI KAŽEJO RAZLIKE V SVOJI VIRULENCI, VIDIK, KI ODRAŽA NJIHOVO RASNO SPECIFIČNOST. PO DRUGI STRANI RAZLIČNI PATOVARES P. SAVASTANOI POVZROČAJO PODOBNE SIMPTOME (TUMORJE) TAKO PRI OLESENELIH KOT PRI ZELNATIH GOSTITELJIH. ZARADI RAZPOLOŽLJIVOSTI ZAPRTIH GENOMOV SEVOV PPH 1448A IN PSV NCPPB 3335 TER GENSKIH IN FUNKCIONALNIH ORODIJ, RAZVITIH MED IZVAJANJEM NAŠIH PREJŠNJIH PROJEKTOV, SO TE BAKTERIJE IDEALNE ZA ANALIZO SPECIFIČNOSTI GOSTOV IN RAZVOJA VIRULENCE. ZATO BO PRIMERJALNA IN FUNKCIONALNA GENOMSKA ANALIZA FILOGENETSKO SORODNIH BAKTERIJSKIH SEVOV OLAJŠALA IDENTIFIKACIJO DETERMINANT PATOGENOSTI NA RAVNI PATOVAR IN PASME. GLAVNI CILJI TEGA PROJEKTA SO: 1) FUNKCIONALNO OPREDELITI IN OPREDELITI RAZLIKE V NIZU VIRULACIJSKIH GENOV PSV PATOVARS IN PPH PASEM, POVEZANIH S SPECIFIČNOSTJO GOSTITELJA; IN 2) UPORABITI INFORMACIJE, PRIDOBLJENE S PRIMERJALNIM IN FUNKCIONALNIM GENOMOMOM, ZA RAZVOJ DIAGNOSTIČNIH ORODIJ ZA PASME PPH IN NASTAJAJOČE IZOLIRANE PSV V MANDEVILLI. POSEBNI CILJI SO: 1) DODELITI PATOVAR SEVOM P. SAVASTANOI, IZOLIRANIM IZ M. SANDERI. 2) ZAPOREDJE IN ZAPIS GENOMOV REPREZENTATIVNIH SEVOV PATOVARS IN PASEM P. SAVASTANOI. 3) IZVESTI PRIMERJALNO GENOMSKO ANALIZO IN FILOGENETSKO ANALIZO PSV PATOGENOV IN PPH PASEM. 4) PREUČI BIOLOGIJO IN VLOGO V SPECIFIČNOSTI GOSTITELJA PLASMAIDS TEH BAKTERIJSKIH SEVOV. 5) POGLOBITI VLOGO V GOST SPECIFIČNOSTI SISTEMOV IZLOČANJA, EFEKTORJEV SISTEMA IZLOČANJA TIPA III IN, 6) DRUGIH VIRULENČNIH DEJAVNIKOV. 7) PREUČITI VLOGO GENEGA IZRAŽANJA V SPECIFIČNOSTI GOSTOV. 8) RAZVITI POSEBNA DIAGNOSTIČNA ORODJA ZA IZOLATE MANDEVILLA IN PPH PASEM.
