NRPBV že dolgo vodi omrežje Natura 2000 na svojem ozemlju in tako prispeva k ohranjanju habitatov in vrst, ki so v interesu Skupnosti, v dobrem stanju ohranjenosti. Od začetka 21. stoletja PNRBV upravlja omrežje Natura 2000, zlasti v departmaju Voges. Cilj projekta je nadaljevati to animacijo v obdobju 2019–2021: izvajanje posebnih ukrepov upravljanja (zlasti prek pogodb natura 2000 in zlasti listine natura 2000), znanstvenega spremljanja, ozaveščanja (splošna javnost in šola) ter teritorialnega spremljanja.