CGET je skupaj z Generalnim sekretariatom za evropske zadeve odgovoren za usklajevanje evropskih strukturnih in investicijskih skladov iz člena 123 Splošne uredbe Evropske unije in v okviru Sporazuma o partnerstvu. V skladu s členom 117(1) splošne uredbe je odgovorna za usklajevanje dejavnosti informiranja in komuniciranja v zvezi z enim ali več skladi. V skladu s členom 72(2) „Splošne uredbe“ SYNERGY, informacijski sistem (IS) za evropske sklade, sestavljen iz različnih aplikacij z deljenim upravljanjem, omogoča spremljanje skladov, programov in partnerskega sporazuma v programskem obdobju 2014–2020. Za ESRR in ESS je SYNERGIE odgovoren za usmerjanje, spremljanje, upravljanje, certificiranje, nadzor in revizijo. Vendar lahko organi upravljanja vzpostavijo informacijske sisteme za upravljavske module, usmerjanje, spremljanje in potrjevanje svojih programov, medtem ko je treba nacionalni nadzor, revizijo in usmerjanje izvajati v sistemu SYNERGIE. Ta operacija zajema financiranje delovnega mesta direktorja programa Presage-Synergie in vse s tem povezane stroške ter posredne stroške, povezane s tem delovnim mestom za leta 2016 do 2019.