Da bi sistematično izboljšali razmere na nivojskih prehodih, se je leta 2019 začel izvajati program za nadgradnjo nivojskih prehodov z izbiro najzahtevnejših nivojskih prehodov za izboljšanje prometne varnosti, katerih preoblikovanje bi družbi prineslo največje koristi. Nivojski prehodi (Lentvaris-Vievis (38+855 km) in Kyviškės – Valčiūnai (18+419 km) na tovorni poti vseevropskega prometnega koridorja IXB so izbrani za posodobitev kot eden najbolj tveganih in nevarnih. Potrebni so dodatni ukrepi za organizacijo prometa in varnost v prometu, da se zagotovita varnost in pretok najbolj tveganih prednostnih nivojskih prehodov. Cilj projekta je zagotoviti varen promet vlakov, avtomobilov in pešcev z namestitvijo križišč druge stopnje prometa Lentvaris-Vievis (38+855) in Kyviškės – Valčiūnai (18+419). Med izvajanjem projekta se načrtuje zapiranje nivojskih prehodov, namestitev križišča 2. stopnje, gradnja predora Lentvaris – Vievis (38+855) na nivojskem prehodu in viadukt avtomobilov Kyviškės – Valčiūnai (18+419) na nivojskem prehodu, odstranitev enostopenjskega križišča Lentvaris – Vievis (38+855) in Kyviškės – Valčiūnai (18+419) na nivojskih prehodih, razstaviti servisirano opremo APS in prečkati progo, organizirati dostop do novih struktur, posodobiti pripadajoče sisteme in prenesti nove strukture na operaterja za obratovanje. Namestitev dvonivojskih križišč bo izboljšala učinkovitost upravljanja prometa, povečala prometno varnost, zmanjšala verjetnost in število nesreč in smrtnih žrtev ter poškodb, ki se lahko zgodijo na nivojskih prehodih (v primerjavi s prejšnjim letom), povečala zmogljivost, zmanjšala omejitev hitrosti za vlake na nivojskih prehodih in skrajšala čas vožnje z vlakom (v primerjavi s časom potovanja s sedanjo omejitvijo hitrosti). Če se odpravi enostopenjsko križišče, je pričakovani in pozitiven vpliv na okolje ta, da če ni potrebe po upočasnitvi vlakov pred nivojskimi prehodi in po pospešitvi, bo prehod nivojskega prehoda povzročil zmanjšanje emisij CO2.