A) Poudarjamo, da so si udeleženci razpisa zastavili cilje pred dvema letoma, da vsak dan sodelujejo pri teh načrtih in lahko dosežejo številne spodbudne predhodne rezultate. Zaradi pomanjkanja virov ti rezultati niso sistematični: delali smo z nekaj aktivnimi molekulami, malo patogenov, in vivo testi manjkajo. Uspešna vloga bi zapolnila to vrzel. Naš delovni načrt ima dva podprograma, ki ju predstavljamo, ki opisujeta predhodne rezultate, načrte in pričakovane prebojne rezultate. Podprogram 1 1.1 Testiranje antibiotikov odpornih sevov proti AMP (Pál), popolno sekvenciranje genoma (Kondorosi) in bioinformatična analiza rezultatov (Papp) 1.2 AMP – nizkomolekularne kombinacije antibiotikov (Pál, Papp) 1.3 Sinteza novih gradnikov za mimetične zložljive snovi AMP (Fülöp), preklapljanje in čiščenje sekvenc (Martinek, Tóth) in biofizikalna karakterizacija (Martinek) 1.4 Preskušanje podprograma 2.1 Proizvodnja analogov SSB-C foldamerov (Martins), stabilizacija premostitvenih verig (Tóth), sinteza potrebnih monomerov (Fülöp) in vitro za zaviranje PPI. 2.2 SSB-C Mymetics – Strukturna karakterizacija Reco-WH interakcije (Martinek) 2.3 SSB-C Analogi Optimizing Dynamic Covalent Library Method. Študije penetracije celic (Martin) 2.4 V realnem času evolucijske študije in vitro, protibakterijsko preskušanje (Pál, Papp), študije toksičnosti (Göldesi). B) 1. PODPROJEKT: Protimikrobni peptidi AMP so kratki peptidi z različno strukturo in funkcijo, ki ščitijo gostitelja pred različnimi mikrobnimi okužbami. Najdemo jih v rastlinah, živalih, glivah in so del primarnega sistema zaščite pred patogeni. [Narava 2002, 415, 389] Čeprav so ostali učinkoviti v razvoju, njihova praktična uporaba povzroča številne težave, od katerih sta dve osredotočeni na: 1) Trenutno poteka resna razprava o razvoju odpornosti proti tem molekulam in, če je tako, kakšne škodljive stranske učinke ima lahko. [FEMS Microbiol Lett 2012, 330, 81] 2) Nadaljnja težava pred klinično uporabo peptidov je, da jih je včasih težko aplicirati in absorbirati ter jih lahko razgradijo encimi, ki tanjšajo beljakovine (proteaze). Njihova stabilnost in vivo je pogosto nezadovoljiva. Naše predhodne preiskave kažejo, da je te težave mogoče premagati. Poleg tega so AMP še posebej učinkoviti proti bakterijam, odpornim na več zdravil. Če želite to narediti, je treba izbrati AMP, proti katerim ne opazimo odpornosti. Te molekule so osnova za nadaljnji razvoj: medtem ko ohranjamo zgoraj ugodne strukturne in funkcionalne lastnosti, oblikujemo tako imenovane peptidomimetične zložljive molekule. Naš cilj je dokazati, da je kombinacija teh peptidomimetikov z antibiotiki izjemno učinkovita v boju proti odpornosti. Predhodni rezultati in načrti: Ahilovo peto bakterij, odpornih na več zdravil, lahko napadejo AMP. Podrobni testi genetske, biokemične, fenotipusne in genomske ekspresije skupin, ki so jih vodili Csaba Pál, Balázs Papp in Éva Kondorosi, so potrdili, da so se membranska struktura, togost in membranska sestava odpornih bakterij pogosto bistveno spremenila. [NAT Commun 2014, 5, 4352; Mol Syst Biol 2013, 9, 700] Ker je glavni cilj večine AMP bakterijska membrana, je bilo predlagano, da odpornost na antibiotike vpliva tudi na dovzetnost za AMP. Rezultat je bil nepričakovan in zelo zanimiv. 90 % sevov, odpornih na več zdravil, je postalo preobčutljivost za več AMP: v primerjavi z izhodiščnimi kontrolnimi sevi se je občutljivost teh sevov na splošno povečala za dva do trikrat. To kaže na resne stroške razvoja odpornosti na antibiotike, ki jo je mogoče izkoristiti s sočasno uporabo antibiotikov in antibiotikov. Učinkovito kombinirano zdravljenje z antibiotiki AMP. V naslednjem koraku se partnerji osredotočajo na dve ključni vprašanji. Ali obstajajo AMP, ki se dajejo sočasno z antibiotiki (a) in vitro zavirajo odpornost na novo in (b) učinkovito uničujejo bakterije, odporne na več zdravil. Njihove študije se osredotočajo na dva programa upravljanja: peptid NCR335 in družina selfininovih peptidov v PGLA. Pri obeh peptidih je 90–100 % sevov, odpornih na več zdravil, ostalo zelo občutljivih nanju. Predhodni rezultati: a) bakterije, odporne na tetraciklin in ciprofloksacin, so postale bolj občutljive na ta zdravila z dodajanjem PGLA antibiotiku. Učinek je dramatičen v več primerih: antibiotična občutljivost se poveča 10–50-krat z zelo nizkim (subinhibitornim) odmerkom PGLA.
