Projekt „Mikroorganizmi in biološka tkiva: od ravnovesja do patologije" bo cilj opisati vlogo interakcij med mikroorganizmi (ali metaboliti, ki jih ti proizvajajo) in biološkimi tkivi v treh kontekstih: — normalno stanje (rast celic), – stanje črevesne patologije (vnetje vrste Crohnove bolezni), – povezano zunaj črevesno patološko stanje (migrena). Za doseganje ciljev tega projekta je slikanje visoke ločljivosti bistvenega pomena. Pridobitev najsodobnejše opreme, nameščene na dveh platformah Clermontese, je postala nujna in prednostna naloga. Inovativni pristop se bo izvajal s korelacijo različnih načinov slikanja z naraščajočo ločljivostjo (fotonični/konfokalni/elektronski). Pridobijo se lahko dodatne informacije o strukturi, funkciji, dinamiki (in vivo in slikanju v realnem času) in kemijski sestavi preučevanega modela. Namen projekta strukturiranja, ki vključuje več skupnih raziskovalnih enot (UMR) lokacije Clermontois (GreD, Neuro-Dol, M2iSH, IMoST) in povezanih platform (CICS, GReD-CLIC), je odgovoriti na vprašanja, ki so trenutno ključna na področju vloge črevesne mikrobiote in njenih metabolitov pri fiziologiji in patologiji.