NPR Ballons des Vosges je od leta 1995 vključen v izvajanje omrežja Natura 2000 na svojem ozemlju. NPR Ballons des Vosges že več kot 15 let upravlja območja za pripravo objektivnih dokumentov, saj je bilo zgrajeno omrežje Natura 2000. Od takrat NPR ohranja projektno vodenje za izvajanje objektivnih dokumentov. Danes je 28 območij (24 posebnih ohranitvenih območij in 4 posebna območja varstva), ki jih park gosti na 79.000 ha, kar predstavlja skoraj četrtino njenega ozemlja. 24 POO in 2 POV se nanaša na regijo Grand-Est (približno 56 563 ha). Projekt obravnava animacijo 24 območij Natura 2000, ki jih upravlja NPR Ballons des Vosges, nadaljevanje animacije objektivnih dokumentov, njihovo posodabljanje, pa tudi nadaljevanje posvetovanj z lokalnimi akterji, zlasti z usmerjevalnimi odbori. Animacijo interno izvaja ekipa, ki dela na projektu.