Cilj projekta BioAlpine je oceniti učinke globalnih sprememb (podnebje in onesnaženost zraka) na biotsko raznovrstnost visokogorskih alpskih jezer v tesnem sodelovanju z upravljavci naravnih območij in gorskimi uporabniki, ki lahko pomenijo dodatne pritiske, ki še bolj obremenjujejo ta ranljiva okolja (pašništvo, dejavnosti na prostem, lov, ribolov itd.). Z boljšim razumevanjem delovanja jezer bo mogoče opredeliti možne vzvode upravljanja in opredeliti najbolj ogrožena jezera, ki jih je nato mogoče prednostno razvrstiti za ohranitvene, varstvene ali obnovitvene ukrepe.