Zagotavljanje učinkovite podpore za izvajanje FEnIKS s strani Ministrstva za zdravje kot posredniškega telesa za prednostno nalogo VI z zagotavljanjem ustrezne institucionalne zmogljivosti (plače zaposlenih, oprema delovnih mest, usposabljanje, stroški institucij) in zagotavljanjem ustreznega postopka izbire projektov, nadzora, spremljanja, ocenjevanja, napredovanja