Predmet projekta Spremljanje in kartiranje izbranih vrst rastlin in živali ter spremljanje zavarovanih območij (delo na monitoringu 3) je sklop aktivnosti, ki dopolnjujejo in posodabljajo znanje o pojavljanju in stanju vrst, pomembnih za varstvo narave (evropsko pomembne vrste, vrste posebnega varstva, redke in ogrožene vrste) in naravnih habitatov, tako na nacionalni ravni kot na ravni stanja vrst in habitatnih objektov zavarovanih območij.